采用相差顯微鏡也可以對細(xì)胞核、染色體、核仁、線粒體裁等細(xì)胞器進行活體觀察。

　　活體觀察法的優(yōu)缺點與固定法正好相反。它有優(yōu)點是能夠如實地反映生活細(xì)胞的情況。這就必須嚴(yán)格控制條件（即溫度不宜過高），zui大限度地使所觀察的細(xì)胞保持正常生活的狀態(tài)?；铙w觀察缺點是顯示細(xì)胞結(jié)構(gòu)的精細(xì)程度較差。由于 組織培養(yǎng)方法的不斷改進，能夠進行活體觀察的細(xì)胞種類也大有增多。

　　能吸收紫外線一類短波長能量，產(chǎn)生可見光的化合物叫做熒光物質(zhì)。

　　把微生物所*的，或者和微生物親合性很高的熒光物質(zhì)與微生物相結(jié)合后，便可以用熒光顯微鏡來觀察。用藍(lán)光堿性蕊香紅B （rhodaznineB ）和堿性槐黃O （auramine 0）檢定結(jié)核菌就是一例。

　　另外，熒光抗體法也已在微生物學(xué)的各個領(lǐng)域中使用。熒光顯微鏡的光源可以用高壓水銀燈，可見光用濾光片除去。

　　將顯微鏡筒分作并列的兩部分，使其光軸成一適當(dāng)角度，這樣就可以看到立體象。

　　使物鏡作旋轉(zhuǎn)臺式（turrct）旋轉(zhuǎn)，借助可變焦距的透鏡就可以改變放大倍數(shù)，zui高放大倍數(shù)約100 倍左右。

　　在微生物學(xué)領(lǐng)域里，適于用來觀察霉菌菌落或者觀察為霉菌所浸染的植物體。